蛋白质定性分析：蛋白质序列分析，肽指纹图谱分析等2、相对定量蛋白质组学研究：血液、组织、细胞以及细菌等样品的非标和标记定量蛋白质组学分析。3、翻译后修饰（PTM）蛋白质组学研究：磷酸化、糖基化、甲基化、乙酰化等修饰位点的鉴定。
包括四极杆质量过滤器、线性离子阱和 Orbitrap质量分析器； 高达500,000 FWHM的超高分辨能力。用于MS和MSn实验的同步母离子选择（SPS）显著提高了可识别的肽段和蛋白质，提高了使用同重同位素标记（TMT）时的定量精度
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